Анализ нуклеотидных последовательностей гена GPCR представителей рода CAPRIPOXVIRUS с помощью спекл-интерферометрии GB-спеклов и вычитания их изображений

Салтыков Ю.В. ¹, Ульянов С.С. ², Колосова А.А. ¹, Филонова Н.Н. ¹, Федорова В.А. ¹

1. Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии, филиал в Саратове

2. Саратовский государственный университет, Россия, Саратов; Федеральный исследовательский центр вирусологии и микробиологии, филиал в Саратове

В данной статье рассмотрены алгоритмы преобразования нуклеотидных последовательностей (биодигитализации) гена GPCR представителей рода Capripoxvirus в виртуальные оптические спеклы (GB-спеклы). Для различных штаммов вирусов заразного узелкового дерматита крупного рогатого скота и оспы овец получены двумерные распределения интенсивности и фазы GB-спеклов. С целью выявления различий между исходными нуклеотидными последовательностями были изучены интерференционные картины, появляющихся суперпозиций GB-спекл полей и разности изображений GB-спеклов. Показана возможность использования цветных GB-спеклов для выявления различий между сопоставляемыми нуклеотидными последовательностями. Продемонстрирована высокая эффективность предложенных методов для детекции полиморфизма нуклеотидных последовательностей гена GPCR как молекулярной основы внутривидовой дискриминации каприпоксвирусов. _________________________________________________________________________________________________________________________________________ https://doi.org/10.24411/2541-9269-2020-10202

Ключевые слова: нуклеотидные последовательности, спекл-интерферометрия, цветные GB-спеклы, вычитание изображений.

Библиографическая ссылка

Салтыков Ю.В. ¹, Ульянов С.С. ², Колосова А.А. ¹, Филонова Н.Н. ¹, Федорова В.А. ¹ Анализ нуклеотидных последовательностей гена GPCR представителей рода CAPRIPOXVIRUS с помощью спекл-интерферометрии GB-спеклов и вычитания их изображений // Математическое моделирование, компьютерный и натурный эксперимент в естественных науках. – 2020. – № 2;
URL: mathmod.esrae.ru/30-111 (дата обращения: 29.04.2024).

Код для вставки на сайт или в блог